Современная компоновка грузовой палубы ВС ИЛ-96-400Т позволяет использовать при размещении груза различные схемы погрузки и средства пакетирования.

ВС имеет две грузовые палубы, верхнюю и нижнюю.

Верхняя палуба представляет собой грузовую кабину размером 580 м3. Погрузка на верхнюю палубу осуществляется с помощью погрузчика через грузовой портал размером 4850*2875 мм, расположенный по правому борту, что позволяет оперировать нестандартными грузами. В ВС ИЛ-96-400Т размещение груза осуществляется с применением современных средств пакетирования (ULD). На верхней палубе возможно несколько вариантов компоновки паллет.

Нижняя палуба состоит из двух грузовых отделений размером 114 м3 и 82 м3 соответственно. Загрузка осуществляется с помощью вышки загрузчика через два грузовых люка, расположенных по правому борту в носовой и хвостовой частях самолета и имеющих размеры 2690*1840 мм и 2690*1730 мм соответственно. Параметры нижней палубы ВС позволяют произвести погрузку в следующих вариантах компоновки паллет.

Максимально возможная загрузка ВС составляет 92 тонны. Обе грузовые кабины сертифицированы и соответствуют стандартам IACA в части предотвращения нелегального проникновения в грузовые отсеки и доступа непосредственно к грузу, что позволяет максимизировать безопасность перевозки и обеспечить высочайший уровень сохранности груза.